Cruce de caminos donde la PY04 parte hacia Pilar, San Ignacio es la puerta del circuito jesuítico de Misiones. Su Museo Diocesano de Arte Jesuítico reúne unas 30 esculturas de madera policromada talladas por guaraníes, repartidas en cuatro salas: La Creación, La Redención, Cristo en la Iglesia y la Compañía de Jesús. Es un museo vivo, donde también se dan clases de pintura, canto y tallado. La ciudad es buena base para Santa María de Fe, Santa Rosa, Santiago y, en Semana Santa, Tañarandy.

Fue fundada el 29 de diciembre de 1609 por los jesuitas Marcial de Lorenzana y Francisco de San Martín, con el cacique Arapysandú, como primera reducción jesuítica del Paraguay. De aquel pueblo quedan construcciones y, sobre todo, las imágenes barrocas que hoy exhibe el museo. Se la llama Capital del Barroco Hispano-Guaraní.